社会システムイノベーションセンターは、神戸大学が推進するデジタルバイオ・ライフサイエンスリサーチパーク（DBLR）推進機構における「社会システムイノベーション研究拠点」（研究拠点長：金子由芳）の中核を担い、「バイオものづくり協創研究拠点」、「医工学研究拠点」、「先端膜工学研究拠点」、「健康長寿研究拠点」との拠点間連携を創出し、未来社会に向けた課題解決のために実践的な研究提言を進めています。
なかでも、2025年に健康長寿研究拠点との連携が先行して開始した「加点式健診事業（よいとこ健診）による地域活性化プロジェクト」は、神戸市内における実践を通じた調査活動を通じ、健康およびまちづくりにおける効果の検証を重ねています。
このほか、「バイオものづくり協創研究拠点」との連携により温室効果ガス排出削減に貢献する企業活動の標準化、また「医工学研究拠点」との連携により神戸発の医療機器の世界的な市場展開に資する制度研究などを推進しています。
